Stanford University
Night vision

与跟踪动物的DNA

遗传物质留下的动物能提供线索,以助保护和研究的关键。新的研究表明DNA的土壤样本中学习可以比传统的跟踪方法,如相机陷阱,用于评估生物多样性更有效,高效和负担得起的。

通过抢约旦,斯坦福伍兹环境研究所
时钟2020年1月14日

这是很难保障的东西你不能找到。一项新的研究揭示了留守DNA可以为保护工作提供了宝贵的信息,对动物斯坦福土壤取样 - 用成本和时间大大较少 - 比目前使用的方法,如相机陷阱。

这个过程中,概述了一月14 皇足球外围网学会会报B,也证明了在区分外观相同的动物之间的遗传差异,否则,一项艰巨的任务在传统的跟踪途径有效,甚至可能会发现以前未知的物种多样性,根据研究人员。虽然该技术仍需要细化,作者都看好它有朝一日革命性的野生物种的研究。

“我们需要在这样一个质的飞跃,我们识别和追踪动物,”研究主要作者 凯文leempoel,博士后研究员在生物学在足球外围官网。 “这可能是它。”

有希望的解决方案

灭绝的阴影笼罩着比所有动物物种的四分之一以上,按的最佳估计 为自然保护国际联合会,它维护受威胁和灭绝物种的名单。有极端的动物保护主义者在动物种群在地球的每一个区域记录的下降。

关键大规模保护工作 - - 最有前途的工具,用于生物多样性监测的一个是环境的DNA,或埃德娜的研究中,动物废弃材料,如毛发,粪便,皮肤和唾液。提取DNA后,科学足球外围网们把它比作序列和DNA序列数据库在网上确定的品种。相对这是一个快速,低维护过程与传统方法相比,比如现场捕获,动物跟踪和照相机拍摄,是研究物种多样性,分布和数量。研究人员花了4500所有的$关于学习用品等,比实验室设备等。对一项类似的研究与相机陷阱耗资超过莫非两倍。

尽管优势明显,约埃德娜分析的有效性问题一直保持。因为这部分大多数研究至今,一直只在海洋和淡水环境中完成的。在陆地上做了一些研究,大多数都在封闭的区域去过,动物园如,或仅限于少数几个物种。

眼看着看不见

足球外围官网1193英亩的 碧玉岭生物保护,Leempoel他和他的同事埃德娜在土壤中就读。不但几乎每一个确定他们的动物,察觉了附近的相机陷阱在过去四年里,他们还发现了一些小型哺乳动物,蝙蝠的遗传证据,包括田鼠,很少,如果由摄像机看到的。这些生物逃脱了可能HAD摄像机的注视过小,因为它们是触发它们。总体而言,在在兽的存在有30天的地区发现动物的埃德娜的80%的机会。

埃德娜是区分品种,看起来像的可能性的另一个优点。例如,研究人员发现土壤样品中的挪威大鼠的DNA,证实ESTA物种的该区域的存在首次。以往的调查相机不能告诉挪威和黑鼠之间的差异。

用相机记录等观测相比,埃德娜眼看就要密切相关标识与该地区是如何频繁,最近的动物去过。分析结果显示,没有獾的暗示 - 对过去四年未记录的相机 - 足球外围网猫或黄鼠狼 - 在过去两年风行照相机只有几次。

“有确凿的动物的照片与他们的基因遗迹的环境中,这项研究揭示了两个隐藏在陆地生态系统的生物多样性和这些技术将如何工作埃德娜在其他地方,”研究资深作者 伊丽莎白·哈德利,保罗秒。和比利跟腱在足球外围官网环境生物学教授 人文科学学院.

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我们需要在我们识别和追踪动物的方式的飞跃。 ESTA可能是吧。

迈向新范式

尽管有这些积极的结果,问题仍然埃德娜分析的潜力。科学足球外围网不知道如何动物必须考虑到是埃德娜样品,或者如何近期必须是通道的检测区域频繁传递一个常见问题。如果动物的大小会影响DNA的它留下,作为研究人员推测量,一些动物会很少来,而其他将被过多取样。没有人知道所需的体积和数量的样本应该被收集最大精度,这环境源 - 土壤或别的东西 - 是多才多艺的大部分或全部种检测是否甚至通过埃德娜分析。

出现了研究结果overrepresent一些物种中,美洲狮和:比如山猫,可能是由于猫越来越频繁地标记他们的尿液和粪便随着领土的习惯,因为它们使用的路径通常如这里的土壤样本研究人员耗时。一般来说,这是不可能知道的皮肤,皮毛或干SCAT是否片被风或其他物种曾食用动物的猎物运。

也许最重要的是,DNA不完整的数据库和研究设计的局限性使其难以检测存在于该地区的所有物种,和两个至少造成其中的结果不一致接近基因测序研究人员使用。埃德娜分析耗时仍然相对因为还没有被证明是建立协议。尽管如此,研究人员看好办法的承诺。

“它的整体精度,加之降低基因测序和新的便携式音序器的成本,埃德娜打造一个可能的候选人成为在未来十年生物多样性调查的标准,” leempoel说。

hadly也是足球外围官网的碧玉岭生物的课程主任保留,足球外围官网的一员 生物-​​X 而在高级研究员 足球外围官网伍兹环境研究所。特雷弗·赫伯特,在碧玉岭生物学术技术专足球外围网保留,也合着的研究。

这项研究是由瑞士国足球外围网科学基金会,梅隆的拨款,足球外围官网和霍华德休斯医学研究所资助。

媒体联系人

凯文leempoel

生物学

 leempoel@stanford.edu,650-229-9482

伊丽莎白·哈德利

生物学

hadly@stanford.edu,650-245-1775

抢乔丹

足球外围官网伍兹环境研究所

rjordan@stanford.edu,650-721-1881

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